世界快看点丨MCE | 组蛋白甲基化

组蛋白甲基化通常发生在 H3 和 H4 的精氨酸 (Arg 或 R) 和赖氨酸 (Lys 或 K) 残基上。这些精氨酸和赖氨酸都可以被单甲基化或二甲基化,赖氨酸还能再被三甲基化。组蛋白的甲基化修饰受到组蛋白甲基转移酶 (HMTs) 组蛋白脱甲基化酶 (HDMs)调控。但与乙酰化修饰的生物学效应不同,甲基化后组蛋白赖氨酸残基可以激活或抑制基因转录,这取决于具体的情况 (如甲基化的位点,状态等),例如 H3K4me2/3, H3K36me1/3, H3K79me1/2 和 H4K20me1 与转录激活相关,而 H3K9me2/3, H3K27me2/3, H3K79me3 和 H4K20me3 与转录抑制相关。

HMTs 和 HDMs 调节基因表达的实例

写入: 组蛋白甲基转移酶 (HMTs)

组蛋白甲基转移酶 (HMTs) 分为两类:赖氨酸甲基转移酶 (KMTs) 精氨酸甲基转移酶 (PRMTs)


(资料图)

KMTs 根据催化结构域序列,可分为含 SET 结构域和非 SET 结构域。SET 结构域是组蛋白甲基转移酶的重要结构域,也是大多数转移酶含有的结构域,负责甲基转移酶的酶促活性,包括 SUV39, SET1, SET2, EZH (著名的 EZH2 就在这个家族啦, 可对 H3K27 进行单,二和三甲基化),RIZ (PRDM, SMYD, SUV420) 等家族。而不含 SET 结构域的蛋白较少,如 DOT1L 蛋白。DOT1L 是已知的靶向组蛋白 H3K79 位置的组蛋白甲基转移酶。H3K79 位于组蛋白 H3 的球状结构域中,但它暴露在核小体表面上,在这里它可以被 DOT1L 甲基化。因此,DOT1L 的催化发生在核小体表面而不是 N 末端尾巴上。

PRMTs 根据其催化活性可分为三类,催化精氨酸的单甲基化 (MMA)不对称 (ADMA) 或对称二甲基化 (SDMA)。I 型 PRMTs (PRMT1, PRMT2, PRMT3, PRMT4, PRMT6 和 PRMT8) 产生单或不对称二甲基化精氨酸 (ADMA),II 型 PRMTs (PRMT5 和 PRMT9) 产生单或对称二甲基化精氨酸 (SDMA)。而 Ⅲ 型的 PRMT7,只产生 MMA。组蛋白甲基化转移酶的成员实在不少,并有各自的识别位点,就列在树上给小伙伴们看吧。

蛋白甲基转移酶的系统发育树

擦除: 组蛋白脱甲基酶 (HDMs)

组蛋白去甲基化酶与转移酶的作用相反。组蛋白去甲基酶既能靶向组蛋白又能靶向非组蛋白底物。目前已经鉴定出两个进化上保守的组蛋白去甲基化酶家族:赖氨酸特异性去甲基化酶 (LSD)Jumonji C (JMJC)蛋白家族,它们利用不同的反应机理来去甲基。LSD 蛋白家族由 LSD1 和 LSD2 组成,它们通过 FAD 依赖的胺氧化反应 (flavin adenine dinucleotide-dependent amineoxidase) 对单和二甲基化的赖氨酸残基进行脱甲基化。其中 LSD1 (KDM1A) 是第一个发现的组蛋白赖氨酸脱甲基酶 (KDM), 催化 H3K4me1/2, H3K9me1/2 的脱甲基化,另外,LSD1 也可以对非组蛋白脱甲基化,如 p53 上的 K370me1 和 K370me2, DNMT1 上的 Lys1096 和 E2F1 上的 Lys185。

LSD1 作为转录阻遏物和激活物
LSD1 对 p53 活性的调节

而 JMJC 家族催化的脱甲基酶反应是一种依赖于铁 (II) 和 α-酮戊二酸的双加氧酶 (Fe(II)/α-ketoglutarate-dependent hydroxylase) 反应。这使得 JMJC 家族的酶与 LSD 家族不同,能够脱三甲基赖氨酸残基。JMJC 家族由 30 个成员组成,目前为止,这些成员中的 18 个已显示具有组蛋白脱甲基酶活性。因为组蛋白脱甲基化酶的成员也实在不少,就不一一列举了,小伙伴们可以参考这个表。

组蛋白去甲基化酶家族[6]

读取:组蛋白甲基化的识别蛋白

甲基化组蛋白的识别是通过具有甲基结合域的蛋白来实现的,这些结合域包括 ADD, Ankyrin, BAH, Chromobarrel, Chromodomain, Double Chromodomain (DCD), MBT, PHD, PWWP, TTD, Tudor, WD40 以及 zf-CW。其中含 Chromodomain, MBT 重复序列,PWWP, Tudor, DCD 蛋白组成了 Royal 超家族。这些域是怎么识别组蛋白甲基化位点呢?许多研究表明,含 Chromodomain 蛋白的 HP1 和 Chd1,分别可以识别 H3K9me 和 H3K27me。而人的 L3MBTL1 蛋白,是已知的转录阻遏物,以严格依赖组蛋白甲基化标记的方式 (如 H4K20me1/2 和 H1K26me1/2) 压紧染色质。L3MBTL1 含有三个 MBT 域,都很重要。例如它的第二个 MBT 结构域对 H1K26me1/2 和 H4K20me1/2 的结合很重要。含有 PHD 手指基序的 BPTF, RAG2, PYGO 和 ING2 都可以识别并结合到 H3K4me3。另外,含 WD40 重复序列的蛋白如 WDR5,可通过与 MLL, RBBP5, ASH2L 和 DPY30 形成蛋白质复合物,促进组蛋白 H3K4 甲基化。

组蛋白甲基化阅读器 (注: PTM: 蛋白翻译后修饰)[10]

如同武林高手组合出招一样,组蛋白甲基化的不同位点和模式可以演化出很多的甲基化修饰模式,增加了受组蛋白甲基化调节的基因表达的复杂性和多样性。而 HMTs 和 HDMs 小心地维持着组蛋白甲基化的水平,因而也就不难理解它们的失调与癌症之间密切的关系,如组蛋白甲基转移酶 NSD1 和 EZH2 在许多肿瘤中过表达,DOT1L 在白血病中有着广泛的作用等等。组蛋白脱甲基酶 KDM1A, KDM5B 分别在低分化神经母细胞瘤和前列腺癌中过表达。LSD1 与 p53 的直接相互作用会降低 p53 的活性,包括 p21 的表达降低,与肿瘤发生有关等等。另外,对组蛋白甲基化标记的误读 (组蛋白甲基化的读取蛋白活性异常) 也与许多人类疾病有关,包括发育异常以及癌症。因此,这些蛋白质的小分子抑制剂是有用的化学探针或潜在的治疗剂。

部分靶向组蛋白甲基化修饰的蛋白抑制剂

化合物

作用

HMTs

Tazemetostat

选择性,具有口服活性的 EZH2 抑制剂,用于治疗上皮样肉瘤;抑制含有 PRC2 复合体的野生型 EZH2 的活性; FDA Approved

GSK126

有效的,选择性的 EZH2 甲基转移酶抑制剂;在体内外明显抑制肿瘤形成,降低细胞迁移,侵袭,逆转耐药

AZ505

有效的,具有选择性的 SMYD2 抑制剂

Pinometostat

有效的 DOT1L 组蛋白甲基转移酶抑制剂; Phase 2

EPZ015666EPZ015666

有口服活性的 PRMT5 抑制剂

MS023

有效的,选择性的,具有细胞活性的人 I 型蛋白精氨酸甲基转移酶 (PRMTs) 抑制剂

HDMs

GSK-J4

有效的 H3K27me3/me2 脱甲基化酶 JMJD3/KDM6B 和 UTX/KDM6A 双抑制剂

GSK2879552

具有口服活性的,不可逆的 LSD1 抑制剂,具有抗肿瘤活性; Phase 1

Seclidemstat

有效的 LSD1 抑制剂; Phase 1

JIB-04

是 Jumonji 组蛋白脱甲基酶广谱抑制剂

Reader

UNC 669

L3MBTL1 和 L3MBTL3 的抑制剂

MCE 的所有产品仅用作科学研究,我们不为任何个人用途提供产品和服务

HY-L005 表观遗传化合物库 Epigenetics Compound Library

缩写:

HMTs: histone methyltransferases

HDMs: histone demethylases

PHD: plant homeodomain

PRMTs: protein arginine methyltransferase

KMTs: histone lysine methyltransferases

DOT1L: Dot1-Like histone methyltransferase

MMA: monomethylarginine

ADMA: asymmetric dimethylarginine

SDMA: symmetric dimethylation

LSD: lysine-specific histone demethylase

KDM: histone lysine demethylases

HP1: heterochromatin protein 1

参考文献

1. Cheng Y, et al. Targeting epigenetic regulators for cancer therapy: mechanisms and advances in clinical trials. Signal Transduct Target Ther. 2019 Dec 17;4:62.

2. Jambhekar A, et al. Roles and regulation of histone methylation in animal development. Nat Rev Mol Cell Biol. 2019 Oct;20(10):625-641.

3. Xin Yi, et al. Histone methyltransferases: novel targets for tumor and developmental defects. Am J Transl Res. 2015 Nov 15;7(11):2159-75.

4. Tian X, et al. Histone lysine-specific methyltransferases and demethylases in carcinogenesis: new targets for cancer therapy and prevention. Curr Cancer Drug Targets. 2013 Jun;13(5):558-79.

5. Michalak EM, et al. s of DNA, RNA and histone methylation in ageing and cancer. Nat Rev Mol Cell Biol. 2019 Oct;20(10):573-589.

6. Kooistra SM, et. Molecular mechanisms and potential functions of histone demethylases. Nat Rev Mol Cell Biol. 2012 Apr 4;13(5):297-311.

7. Milite C, et al. The emerging role of lysine methyltransferase SETD8 in human diseases. Clin Epigenetics. 2016 Sep 22;8:102.

8. Islam AB, et al. Co-regulation of histone-modifying enzymes in cancer. PLoS One. 2011;6(8):e24023.

9. Huang J, et al. p53 is regulated by the lysine demethylase LSD1. Nature. 2007 Sep 6;449(7158):105-8.

10. Musselman CA, et al. Perceiving the epigenetic landscape through histone readers. Nat Struct Mol Biol. 2012 Dec;19(12):1218-27.

11. Zhu H, et al. Molecules. 2020 Jan 29;25(3). pii: E578.Small Molecules Targeting the Specific Domains of Histone-Mark Readers in Cancer Therapy.

12. Albert M, et al. Histone methyltransferases in cancer. Semin Cell Dev Biol. 2010 Apr;21(2):209-20.

13. D"Oto A, et al. Histone demethylases and their roles in cancer epigenetics. J Med Oncol Ther. 2016;1(2):34-40.

14. Arrowsmith CH, et al. Epigenetic protein families: a new frontier for drug discovery. Nat Rev Drug Discov. 2012 Apr 13;11(5):384-400.

15. McCabe MT, et al. Targeting Histone Methylation in Cancer. Cancer J. 2017 Sep/Oct;23(5):292-301.

16. Magliulo D, et al. Lysine-Specific Demethylase 1A as a Promising Target in Acute Myeloid Leukemia.Front Oncol. 2018 Jul 19;8:255

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以下是维力医疗在北京时间3月8日11:04分盘口异动快照:3月8日,维力医疗盘中快速反弹,5分钟内涨幅超过2...

2023-03-08
热点评!畜生道

热点评!畜生道

1、佛教六道轮回中的一道,新译作傍生,为傍行之生类之意。2、畜生,指的是飞禽走兽、蜎蠕虫蚁等。3、据...

2023-03-08
世界热推荐:天将降大任于斯人也必先苦其心志劳_ldquo 天将降大任于斯人也 必先苦其心志 rdquo 的原文 出处 作者及其

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今天小编肥嘟来为大家解答以上的问题。天将降大任于斯人也必先苦其心志劳,ldquo天将降大任于斯人也必先...

2023-03-08
红番茄

红番茄

1、红蕃茄是一家以经营湖北菜为主,融宫廷、养生菜品,高尔夫健身娱乐等项目为一体的综合性餐饮连锁企业...

2023-03-08
数列极差公式_数列极差|焦点滚动

数列极差公式_数列极差|焦点滚动

1、我觉得你写得有点乱给你看我的。2、我是先快排。3、再扫描 includeusingnamespacestd;lo

2023-03-08
通讯!网上怎么查车险到期时间_网上如何查车险到期时间

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网上查车险到期时间可登录保险公司官方网站,输入车牌号等信息进行查询,可以查到自己的车险保单。具体...

2023-03-08
剩斗士

剩斗士

1、“剩斗士”是网友对“剩男”、“剩女”新的称呼之一,指那些“超过国家婚姻法规定的晚婚年龄,仍然保...

2023-03-07
莱特光电:新产品Green Host材料处于小批量供货阶段

莱特光电:新产品Green Host材料处于小批量供货阶段

证券时报e公司讯,莱特光电在接受调研时表示,公司新产品GreenHost材料处于小批量供货阶段,另有RedHost...

2023-03-07
切腹自尽 微头条

切腹自尽 微头条

1、在日本武士道精神中“切腹”这种行为不能不提,他们认为这是光荣赴义。2、切腹虽然是很痛苦的,事实...

2023-03-07
2023海口琼山区府城社区医院四价HPV疫苗价格

2023海口琼山区府城社区医院四价HPV疫苗价格

海口琼山区府城社区卫生服务站四价疫苗价格:四价980 针报名要求:四价仅限20-45岁的女性居民参与疫苗...

2023-03-07
曾经的“央视一姐”,嫁给大18岁的老公,因误诊癌症辞职,投资147万赚了1.2亿_环球动态

曾经的“央视一姐”,嫁给大18岁的老公,因误诊癌症辞职,投资147万赚了1.2亿_环球动态

作者:雪沫编辑:贾方方来源:婚姻与家庭杂志在央视长河中,有太多优秀的主持人,这些人中虽然有人已经...

2023-03-07
昆布是什么

昆布是什么

昆布是《中国药典》收录的草药,是海带科植物海带或翅藻科植物的干燥叶状体。昆布生于低潮线附近的岩礁...

2023-03-07
我的高腰裤什么意思_高腰裤分几种

我的高腰裤什么意思_高腰裤分几种

欢迎观看本篇文章,小升来为大家解答以上问题。我的高腰裤什么意思,高腰裤分几种很多人还不知道,现在...

2023-03-07
泰迪熊犬

泰迪熊犬

1、所谓的“泰迪”,即指“泰迪熊式”贵宾犬,贵宾犬(Poodle),也称“贵妇犬”,又称“卷毛狗”,在德...

2023-03-07
一年级数学 环球时快讯

一年级数学 环球时快讯

1、甲乙两辆汽车同时从东西两地相向开出,甲车每小时行56千米,乙车每小时行48千米。2、两车在距中点32...

2023-03-07
环球观热点:铁路运行图调整需要几天时间_铁路运行图

环球观热点:铁路运行图调整需要几天时间_铁路运行图

1、时间临近春运高峰期。对于选择铁路运输作为出行方式的旅客来说,掌握其运行时间是非常必要的。铁路运...

2023-03-07
血常规检查_快讯

血常规检查_快讯

1、血常规是作为疾病检查的一个重要的辅助项目,对于一些疾病通过检查血液的状况能够判断身体内部的变化...

2023-03-07
3月6日进口棉报价上涨-热消息

3月6日进口棉报价上涨-热消息

3月6日,国际棉花价格指数(SM)101 56美分 磅,涨0 44美分 磅,折一般贸易港口提货价17006元 吨(...

2023-03-07
当前动态:风声剧情介绍

当前动态:风声剧情介绍

1、1942年10月10日,汪伪政权举行了盛大的国民政府庆典。然而,一系列的军政要员遇刺事件,让身为特务处...

2023-03-07
电话号码查公司名称的软件_电话号码查询公司名称

电话号码查公司名称的软件_电话号码查询公司名称

1、望城县宏达电器厂双湖望城县粮食局霞凝粮站丁字望城县霞凝粮站丁字长沙县粮食局榔梨粮管站粮贸商场望...

2023-03-07
“礼让斑马线”成为西青区“风景线”

“礼让斑马线”成为西青区“风景线”

小小斑马线承载着城市交通的安全与规范“礼让斑马线”是文明出行的基本常识也是法律义务更是城市文明最...

2023-03-07
浩方注册账号_浩方注册账号

浩方注册账号_浩方注册账号

2 在跳转的这个页面中,你可以选择注册的方式。3 然后在每个输入框中输入自己的信息,并保留这些信息...

2023-03-06
福昕软件:福昕船舶图纸管理系统系公司新发布产品,现尚处于客户试用和前期推广阶段

福昕软件:福昕船舶图纸管理系统系公司新发布产品,现尚处于客户试用和前期推广阶段

福昕软件3月6日在投资者互动平台表示,福昕船舶图纸管理系统系公司新发布的产品,现尚处于客户试用和前...

2023-03-06
环球快报:桑拿技师

环球快报:桑拿技师

1、蒋艳,女,东莞太子酒店桑拿中心按摩师。2、2004年蒋艳到太子酒店桑拿中心任职按摩师,当时以为酒店...

2023-03-06
每日视点!铁力市精准发力抓招商赋能促振兴发展

每日视点!铁力市精准发力抓招商赋能促振兴发展

铁力市精准发力抓招商赋能促振兴发展

2023-03-06
ata

ata

1、高技术配置(英语:AdvancedTechnologyAttachment。2、简称“ATA”)与由集成驱动电子

2023-03-06
云连线预告|五位代表相约“云”上 共话“以高水平开放促高质量发展”

云连线预告|五位代表相约“云”上 共话“以高水平开放促高质量发展”

云连线预告|五位代表相约“云”上共话“以高水平开放促高质量发展”

2023-03-06
环球速递!中国海诚:公司定增投资数字化转型升级建设项目符合行业发展趋势和公司发展战略

环球速递!中国海诚:公司定增投资数字化转型升级建设项目符合行业发展趋势和公司发展战略

同花顺金融研究中心3月6日讯,有投资者向中国海诚提问,您好:看公司发布的定增公告中提到,要做数字化...

2023-03-06
多巴胺和内啡肽究竟有什么区别 每日快报

多巴胺和内啡肽究竟有什么区别 每日快报

多巴胺和内啡肽都是人体内的两种激素,都能够提供快乐,但是产生的机理不一样。多巴胺是一种奖励机制,...

2023-03-06
预售价9.99万的长安逸达,配置比同价位秦PLUS DM-i高,你会选谁?-世界快消息

预售价9.99万的长安逸达,配置比同价位秦PLUS DM-i高,你会选谁?-世界快消息

在紧凑型轿车中,是众多车企都要竞争的市场,特别是国产品牌,最近的销售数据依然要超越合资品牌的势头...

2023-03-06
世界视点!踏板车什么牌子好

世界视点!踏板车什么牌子好

踏板车牌子好的可以买进口的雅马哈的TMAX系列,或者雅马哈新款巧格等都是很好的品牌。踏板车一种介于摩...

2023-03-06
海口电动车还能上牌吗?

海口电动车还能上牌吗?

解答:1、海口的电动车目前还不能上牌,最新的官方政策还没有出台,还需要一段时间。2、电动汽车分为交...

2023-03-06
环球热点评!镜面反射和漫反射都遵循什么定律_镜面反射

环球热点评!镜面反射和漫反射都遵循什么定律_镜面反射

1、呵呵,这个小朋友的问题很有意思首先,就“看到镜面反射的物”来说,不是取决于镜面反射的是平行光还...

2023-03-06
天天快讯:中国旅游胜地排行榜(30大类)

天天快讯:中国旅游胜地排行榜(30大类)

多时候,想象中的名胜已成为我们心中难解的旅游情结,这里列出一些供大家参考。中国最美的十大名山1黄山2...

2023-03-06
世界动态:特朗普口出狂言,若是成功上位,美国将会完全独立于中国,还会还会要求中方进行“赔偿”!

世界动态:特朗普口出狂言,若是成功上位,美国将会完全独立于中国,还会还会要求中方进行“赔偿”!

为了再次成功坐上总统宝座,特朗普这次真是拼了,直接口出狂言:若是成功上位,将会取消从中国进口所有...

2023-03-06
摩尔庄园警察任务小铲子在哪_摩尔庄园警察任务-天天新消息

摩尔庄园警察任务小铲子在哪_摩尔庄园警察任务-天天新消息

1、东部游乐场的游泳池上的沙滩,用刨子不断地刨。2、2、浆果密道的入口,用一个工具不停地挖。3、3、蘑...

2023-03-05
双星闪耀!梅西造生涯千球 姆巴佩加冕队史射手王 世界速看

双星闪耀!梅西造生涯千球 姆巴佩加冕队史射手王 世界速看

在内马尔因伤休战的这段时间内,梅西和姆巴佩挑起了巴黎的大梁。在上轮对阵马赛时,这两大巨星联袂制造...

2023-03-05
快报:2022六一儿童节放假几天 2022六一儿童节星期几

快报:2022六一儿童节放假几天 2022六一儿童节星期几

2022六一儿童节放假几天是时下大家最关心的,毕竟儿童节对于小朋友们来讲可以说是一年中最为期待的节日...

2023-03-05
江西车牌字母代表地区_江西车牌字母代表|当前通讯

江西车牌字母代表地区_江西车牌字母代表|当前通讯

1、车牌号:甘A2、城市:南昌市3、车牌号:甘b4、城市:赣州市5、车牌号:甘c6、城市:宜春市7、车牌号...

2023-03-05
洲组词_洲

洲组词_洲

1、包含“洲?”的词语:洲渚洲际洲沚洲浦洲屿洲岛洲溆洲场洲淤包含“?洲”的词语:瀛洲汀洲亚洲绿洲

2023-03-05
星月菩提怎么盘玩最漂亮_星月菩提怎么盘玩 天天即时看

星月菩提怎么盘玩最漂亮_星月菩提怎么盘玩 天天即时看

1、先原籽刷干净手盘时适当加点橄榄油要经常刷洗干净否则会污浊透亮建议还玩金刚菩提子金刚菩提子所有菩...

2023-03-05
每日快看:迷霭之森攻略

每日快看:迷霭之森攻略

1、进入迷霭之森奇境关卡后,顺着左侧的路线挑战左侧的敌人并选择遗物。挑战左侧道路的敌人后,挑战前方...

2023-03-05
环球动态:传承雷锋精神 弘扬新时代文明风尚

环球动态:传承雷锋精神 弘扬新时代文明风尚

消息:3月5日是学雷锋纪念日,最近,各地持续开展学雷锋活动,感受榜样力量,传承雷锋精神。这两天,在...

2023-03-05
汽油标号越高说明汽油什么_全球今热点

汽油标号越高说明汽油什么_全球今热点

1、汽油有92号、95号等标号,标号越高,说明汽油?抗爆能力越强。2、汽油标号:是实际汽油抗爆性与标准...

2023-03-05
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